За то, что в нём из-за слишком умной адресной строки не работает очень важный для меня сценарий — поиск по закладкам из адресной строки — которым я часто пользуюсь в Chrome:

Моя закладка на второй строке. Браузер Яндекса в том же случае ставит популярные запросы выше моей закладки:

Меня это не устраивает, так как добавлять в закладки полезные страницы, затем быстро находить их по названию невероятно удобно.

Ну а в целом Яндекс.Браузер мало отличается от Google Chrome, разве что шпионит в пользу другой стороны :)